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MEGA5ベータ版がリリースされました。(5/5/2010)

ダウンロードは　www.megasoftware.net　からどうぞ！
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MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis)は、DNA、タンパク質配列データの分子進化・系統学的解析を行うためのソフトウェアです。最初のバージョンは1993年に開発され、IBM PC-DOS（DOS/Vの英語モード）上で動作しました。その後、バージョン2(MEGA2 )でWindowsアプリケーションになり、バージョン3(MEGA3 )では、系統解析のための配列データ構築機能が装備されました。すなわち、DNAシーケンサからの Trace ファイルや FASTA をはじめとした様々な形式のテキストファイルの入力、内臓Webブラウザを用いたデータベースからのデータの検索（Entrez、BLASTなど）・直接入力に対応しています。集めた配列データは専用アライメントエディタで編集できます。このアライメントエディタは ClustalW、MUSCLE を内蔵し、配列の自動アライメントも可能です。


　MEGA4の機能を紹介するアニメーションです。(※閲覧には Adobe Flash Player が必要です。)

MEGA5 の主な新機能は以下の通りです。

  1. 多重配列アライメントのエンジンとして、ClustalW に加えMUSCLEも搭載。

  2. 最尤法による系統樹推定、分岐年代推定、祖先配列推定、置換モデル選択。

  3. ユーザ指定系統樹の解析（トポロジー編集機能付）

  4. コドン単位の dN/dS テスト（HyPhy搭載による）

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MEGA4 についての詳しい解説は、Barry G. Hall 博士の“Phylogenetic Trees Made Easy: A How-To Manual Third Edition”をお薦めします。

→ Amazon.co.jp へのリンク

MEGA3 チュートリアル（Actin gene coding region を例題として）

MEGAと、このページの内容に関する問い合わせ： 田村浩一郎（ktamura@tmu.ac.jp）まで、お気軽にどうぞ